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感染数据集（第 2 页）

思陌医疗数据服务整理的感染公开数据集，共 280 个，覆盖该领域多模态数据，助力医疗AI研发选型。

共 96 个数据集 · 第 2 / 4 页
数据集名称 系统分类 病种 数据模态 任务类型 描述 来源 原始地址 操作
新冠疫苗降解数据集感染新型冠状病毒肺炎蛋白质序列包含新冠疫苗蛋白质序列及降解率标签的数据集，用于回归预测疫苗降解。Gleghorn Labhttps://huggingface.co/datasets/GleghornLab/cov_vaccine_degradation访问
CovidRetrieval感染新型冠状病毒肺炎文本文本检索一个用于COVID-19文档检索的文本数据集，包含语料库、查询匹配对和查询。mtebhttps://huggingface.co/datasets/mteb/CovidRetrieval访问
COVID-19问答数据集感染新型冠状病毒肺炎文本问答包含1335个COVID-19问答对的文本数据集，用于问答任务。manuhttps://huggingface.co/datasets/manu/covid_qa访问
covid-tweets-100k感染新型冠状病毒肺炎文本文本10万条意大利Covid-19疫情相关推文，含日期和文本，文本小写化。istat-aihttps://huggingface.co/datasets/istat-ai/covid-tweets-100k访问
AVIDa-SARS-CoV-2感染新型冠状病毒肺炎纳米抗体包含两只羊驼抗SARS-CoV-2的VHH序列与12个突变株（包括Delta和Omicron）的结合数据，用于评估纳米抗体结合预测模型。ZYMScotthttps://huggingface.co/datasets/ZYMScott/SARS-CoV-2访问
AVIDa-SARS-CoV-2-Alpha感染新型冠状病毒肺炎蛋白质序列包含SARS-CoV-2 Alpha变体蛋白质结合对数据，以AA序列存储，二分类标签，用于蛋白质结合预测。SeprotHubhttps://huggingface.co/datasets/SeprotHub/Dateset-AVIDa-SARS-CoV-2-Alpha访问
赞比亚结核病患者护理路径及服务改进偏好研究数据集感染结核病该数据集包含在赞比亚卢萨卡两家公共卫生机构收集的成年新确诊结核病患者的调查数据，涵盖临床表格、人口统计学信息和患者偏好实验数据等多模态信息，主要用于分析结核病诊断延迟的关键因素、评估患者对医疗服务特性的偏好，并为优化结核病公共卫生服务、减少https://search.dataone.org/view/sha256:bbedccb1a57af0b9ff6389bfdd46cd11d59bc0771019e450f64b9ecc2f00332b访问
耐多药结核病数据集感染结核病该数据集包含194名耐多药结核病（MDRTB）与药物敏感结核病（DSTB）患者的临床与实验室数据，数据模态包括临床表格（人口统计学、疫苗接种史）、实验室检测结果（药物耐药性模式、血清锌水平）。其主要用途是研究血清锌水平作为生物标志物与结核病https://data.mendeley.com/datasets/4wfswdj23t访问
非洲抗菌素耐药性监测数据集感染感染性疾病表格表格非洲医疗机构抗菌素耐药性监测的合成表格数据集，用于填补非洲AMR数据缺口。electricsheepafricahttps://huggingface.co/datasets/electricsheepafrica/africa-amr-surveillance访问
温度在季节性传染病流行开始中的作用数据感染感染性疾病该数据集包含实验收集的表格数据，记录了不同温度条件下水蚤Daphnia magna宿主与寄生虫Pasteuria ramosa之间的感染动态，具体包括宿主孵化、成熟及寄生虫感染的时间序列统计，主要用于研究温度如何影响季节性传染病流行的起始时https://search.dataone.org/view/sha256:4014a443dea3ba34072686621788a34c250ec3c2eca77900c0df95e81012a5fa访问
碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌肺炎患者中多黏菌素B与替加环素联合疗法的临床结局与安全性回顾性队列研究数据集感染感染性疾病该数据集包含73名碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌肺炎患者的临床记录，数据模态为结构化临床表格，涵盖人口统计学、合并症、治疗信息和临床结局指标，主要用于比较多黏菌素B与替加环素联合疗法的疗效与安全性，并分析死亡风险因素，适用于感染性疾病治疗策略评https://search.dataone.org/view/sha256:3763ab7d4a3029c66fcac75af405c3d4c55a65dfb7d0b10f9fc4841a71b13f8c访问
微生物学1k-问答检索感染感染性疾病文本问答检索微生物学领域的问答检索数据集，包含医学和生命科学相关的知识问答对。puttatidamhttps://huggingface.co/datasets/puttatidam/microbiology1k-mya-qaretrieval访问
bacbench抗生素耐药性蛋白质序列数据集感染感染性疾病蛋白质序列包含25,032个细菌基因组蛋白质序列及抗微生物药物耐药性标签，用于耐药性分类和MIC回归预测。macwiatrakhttps://huggingface.co/datasets/macwiatrak/bacbench-antibiotic-resistance-protein-sequences访问
疟原虫检测YOLO数据集感染寄生虫病医学影像医学影像包含27,558张显微镜血细胞图像，用于疟原虫检测的YOLO格式数据集，mAP50达99.1%。https://huggingface.co/datasets/electricsheepafrica/malaria-parasite-detection-yolo访问
非洲健康疟疾推理数据集感染寄生虫病文本医疗推理30个非洲疟疾医疗案例的文本数据集，包含推理过程、诊断和治疗计划，适用于医疗推理和NLP任务。https://huggingface.co/datasets/Kofi24/afrihealth-malaria-reasoning访问
败血症预测数据集（完整版）感染脓毒症表格预测用于败血症预测的完整数据集，包含约155万条带时间戳的生理参数和患者基本信息。owenpha7https://huggingface.co/datasets/owenpha7/SepsisPrediction_Dataset_Full访问
脓毒症预测数据集感染脓毒症表格预测源自DATATHON竞赛的脓毒症预测数据集，由Dataforce团队创建，具体内容未详细说明。owenpha7https://huggingface.co/datasets/owenpha7/SepsisPrediction_Dataset访问
脓毒症免疫与感染数据集感染脓毒症该数据集包含560名ICU脓毒症患者和3709名健康对照者的临床血液检测数据，数据模态为临床表格和实验室参数，重点关注中性粒细胞、淋巴细胞及单核细胞百分比等免疫指标与降钙素原（PCT）的关联，主要用于脓毒症的免疫机制研究、感染生物标志物探索https://data.mendeley.com/datasets/zt3cztt488访问
假体周围感染数据库（2024年5月28日版）感染假体周围关节感染该数据集包含193例接受假体移除手术的疑似骨科感染患者的临床表格数据，涵盖人口统计学、实验室指标及感染相关参数等多维度信息，主要用于假体周围感染的诊断模型构建、风险因素分析和临床决策支持研究。https://search.dataone.org/view/sha256:c88d3044bfb7ec4a080f379e481f165b2721fb23e6f2aa520e7a1e01fb825660访问
髋膝关节翻修术假体周围感染术前诊断数据集感染假体周围关节感染表格机器学习包含1360例髋膝关节翻修术患者的术前临床数据，用于训练机器学习模型预测假体周围感染。Zenodohttps://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10649339访问
Dataset related to article "Long Pentraxin 3 as a New Biomarker for Diagnosis of Hip and Knee Periprosthetic Joint Infections". 数据集感染假体周围关节感染图像Dataset related to article "Long Pentraxin 3 as a New Biomarker for Diagnosis of Hip and Knee Periprosthetic Joint InfecZenodohttps://zenodo.org/record/7598744访问
Dataset related to article "Preoperative diagnosis of periprosthetic infection in patients undergoing hip or knee revision arthroplasties: development and validation of machine learning algorithm". 数据集感染假体周围关节感染图像Dataset related to article "Preoperative diagnosis of periprosthetic infection in patients undergoing hip or knee revisiZenodohttps://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.10649338访问
Dataset related to article "Agreement Analysis among Hip and Knee Periprosthetic Joint Infections Classifications" 数据集感染假体周围关节感染图像Dataset related to article "Agreement Analysis among Hip and Knee Periprosthetic Joint Infections Classifications" 数据集是与Zenodohttps://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.15112058访问
人工关节周围感染中细菌、免疫细胞与表面形貌的相互作用感染假体周围关节感染该数据集包含人工关节周围感染相关的原始实验数据，涉及细菌、免疫细胞在不同表面形貌材料上的相互作用，数据模态可能包括微生物培养、细胞成像和表面形貌表征等，主要用于研究人工关节感染的发病机制、生物材料与微生物及宿主免疫系统的相互作用，为感染防控Zenodohttps://zenodo.org/record/7950575访问
无乳链球菌人工关节周围感染转录组分析数据集感染假体周围关节感染该数据集包含与人工关节周围感染相关的无乳链球菌转录组学数据，数据模态为基因表达谱，通过高通量测序技术获取，主要用于研究该病原体在人工关节感染状态下的基因表达特征，为深入理解感染机制、开发新的诊断标志物及治疗靶点提供重要的分子生物学数据支持。Zenodohttps://zenodo.org/record/5717630访问
无乳链球菌假体周围关节感染的转录组学分析数据集感染假体周围关节感染该数据集提供了与假体周围关节感染相关的无乳链球菌的转录组学数据，数据模态主要为基因表达谱等生物分子数据，主要用于研究该细菌在假体周围感染中的致病机制、分子特征以及潜在的诊断或治疗靶点，为临床感染性疾病的基础与转化研究提供支持。Zenodohttps://zenodo.org/record/5717631访问
温度对青蛙皮肤细菌抗真菌感染能力影响数据集感染真菌感染本数据集包含北方蟋蟀蛙在可控温度条件下，其皮肤微生物群落（特别是嗜麦芽窄食单胞菌）与壶菌病原体互作的实验数据，数据模态为结构化表格，记录了实验个体的生存、身体状况及病原与特定细菌的负载量，主要用于研究环境温度如何通过调节皮肤菌群影响两栖动物https://search.dataone.org/view/sha256:fb55cd43ca0c0aa81a9bd2852fc2c4177fce91aaa4dca0d2eff26b4fdf5c78d8访问
蛹茧对蚁群卫生育幼行为及真菌感染的影响感染真菌感染该数据集包含蚂蚁暴露于绿僵菌真菌病原下的行为实验数据，主要模态为行为观察记录和感染统计表格，研究了蛹茧存在与否对蚁群卫生育幼行为（如梳理和移除染病个体）及真菌感染限制的影响，旨在探索昆虫社会性免疫机制和蛹茧在病原防御中的进化功能。https://search.dataone.org/view/sha256:5d2dfee22638255b1fd5854063825c8dc3da9824e95d5c07d5cc71558b12b22f访问
PIFIR：PET-CT侵袭性真菌感染报告感染真菌感染文本命名实体识别PIFIR数据集包含PET-CT报告，标注了侵袭性真菌感染相关术语，用于命名实体识别和关系抽取任务。PhysioNethttps://physionet.org/content/pifir/访问
CHIFIR：细胞学和组织病理学侵袭性真菌感染报告感染真菌感染文本文本包含细胞学和组织病理学报告，标注真菌感染术语，用于命名实体识别和关系抽取验证。PhysioNethttps://physionet.org/content/corpus-fungal-infections/访问